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全新IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)應用指南

新一代高內(nèi)涵分析細胞成像系統(tǒng) ─ IN Cell Analyzer 2000在4月底法國里爾的生物分子科學學會 (SBS)第15屆年會上首度亮相?,F(xiàn)場的系統(tǒng)演示贏得了眾多參訪者的肯定及熱烈回響。該系統(tǒng)的靈活性讓研究人員用單個儀器就能完成過去具挑戰(zhàn)性的實驗:從顯微觀察到自動化篩選,以及細胞器、細胞、組織和整個生物體的成像。本文特為您展示全新的IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)如何成為您的得力科研助手。

IN Cell Analyzer 2000有著硬件和軟件的獨特組合,能夠非??焖俚孬@取圖像,是篩選的理想選擇。該儀器是利用六西格瑪原理來設計的,結(jié)構(gòu)堅固,能確保它在多用戶環(huán)境中高通量應用的可靠性。

利用IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)分析干細胞克隆

沿襲 IN Cell Analyzer 1000高質(zhì)量成象,功能完整性及模塊化設計, IN Cell Analyzer 2000新增一些新特征包括:

● 全新硬件設計: 更穩(wěn)定,易操作和一體化主機, 將CO2, 溫控, 液體操控和電源/穩(wěn)壓全部集為一體

● 更快的聚焦和成像掃描速度: 比IN Cell Analyzer 1000提高約一倍

● 增加予掃描功能: 在獲取圖像之前對樣品的選定區(qū)域進行快速的預覽掃描, 使用者可以快速找尋到關(guān)鍵位點并獲取圖像,大幅提升對于干細胞、神經(jīng)突生長等非融合性細胞觀測的準確度及效能

● 高性能大視野CCD和全孔成像:照相機加上寬視野光源,確保一次完成整孔的成像而無需多次成像后的拼接,在單張圖像中捕獲整個細胞孔的信息,提高成像能力

● 更寬范圍高NA值物鏡選擇(2×, 4×, 10×, 20×, 40×, 60×, 100×): 滿足多種靈敏度和放大倍數(shù)的要求

● 全自動物鏡, 分光器和濾光片切換選擇

● 更高圖像分辨率和質(zhì)量: 提供多種圖像分析處理方式 (2D, 2.5D, 3D deconvolution?)

● 三種透視光(白光)成像功能: 亮視野, DIC, 像差

導語

下文的數(shù)據(jù)將顯示全新的IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)的特征如何克服這些困難:(1) 大芯片照相機能在2倍物鏡下實現(xiàn)高通量單圖像全孔捕獲,而圖像陰影小,同時又有足夠的圖像分辨率來區(qū)分單個細胞;(2) 對于高放大率成像,用戶控制的命令能移動/改變目的克隆的物鏡,而無縫圖像拼接實現(xiàn)了高分辨率的全孔成像。

IN Cell Investigator軟件能實現(xiàn)克隆與滋養(yǎng)層細胞的同時分析。此軟件還能自動拼接圖像,測量克隆數(shù)目、大小、形狀,確定細胞數(shù)量,并定量克隆的表型標志物。

方法

包含未分化干細胞克隆和滋養(yǎng)層細胞的預染色固定樣品的96孔板是由加利福尼亞大學干細胞研究中心的Peter Donovan教授饋贈的。所有的細胞核用Hoechst染色,多能細胞通過Oct4的熒光抗體檢測來分析,有絲分裂細胞則利用磷酸組蛋白H3的Texas Red結(jié)合抗體來檢測。培養(yǎng)條件及處理的詳細方法可參照加利福尼亞大學實驗室的近期論文。4,5

圖像獲取

圖像是利用2倍物鏡(0.1NA)、透射光和熒光模式及適當?shù)臑V光片和曝光時間在IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)上獲得的。大的照相機尺寸再加上2倍物鏡,能獲得每邊7.6 mm的視場,在單次圖像捕獲時覆蓋96孔板的全孔區(qū)域(直徑6.5 mm)。圖像還利用4倍物鏡(0.1 數(shù)值孔徑)獲得,此時全孔捕獲就需要4個像場。4倍物鏡圖像有5%的重疊,以便能利用IN Cell Investigator(Developer工具箱)軟件進行圖像拼接。

全新IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)應用指南
全新IN Cell Analyzer 2000系統(tǒng)應用指南

圖1. 96孔板單孔中的干細胞克隆和滋養(yǎng)層細胞在2倍物鏡下的熒光全孔圖像。細胞核經(jīng)Hoechst染色后所獲得的圖像,它標出了干細胞克隆和滋養(yǎng)層細胞中的所有細胞核(A)。多能干細胞則利用熒光標記抗體檢測Oct4表達來鑒定(B)。

圖1顯示了干細胞克隆和滋養(yǎng)層細胞所獲得的典型圖像。此類圖像的定量分析策略概括在圖2中。

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圖2. 干細胞克隆和滋養(yǎng)層細胞的圖像分析。所有的細胞核經(jīng)Hoechst染色(A),并利用IN Cell Investigator(Developer工具箱)的自動化圖像分析來檢測(B)。借助用戶定義的對象擴大、孔填充和大小過濾等后處理工具,這些克隆作為單獨的目標組從所有細胞核中區(qū)分開來(C)。隨后使用目標連接(target-linking)來確定與克隆有重疊的細胞核(D)。一旦所有的目標都被指定,軟件會自動計算這些對象的數(shù)目、形態(tài)描述符以及熒光密度相關(guān)的測定。

圖3顯示了克隆中稀有事件的分析,如有絲分裂細胞的數(shù)量。

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圖3. 干細胞克隆中稀有事件的逐個細胞分析。一旦利用IN Cell Investigator鑒定出干細胞克隆(A, B),就能確定Oct4表達(C)和磷酸組蛋白H3(D)陽性的克隆特異細胞核的數(shù)量。軟件自動計算出表達這些標志物的克隆特異細胞核的比例(E)。

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表1. 圖3E中3個高亮克隆的干細胞克隆分析的典型數(shù)據(jù)。

2倍物鏡所提供的分辨率已足以進行全孔圖像的逐個細胞分析,單個克隆的匯總數(shù)據(jù)如表1所示。我們已經(jīng)將全孔2倍圖像的分析數(shù)據(jù)與4倍物鏡下圖像的對應結(jié)果進行了比較,在4倍物鏡下每孔需要4個視場來完整覆蓋。

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圖4. 2倍與4倍圖像的分析數(shù)據(jù)比較。利用4個像場對4倍物鏡下所獲得的全孔圖像進行了圖像拼接(A)。對2倍圖像(B)及對應4倍拼接圖像中的10個隨機選擇克隆進行了分析。柱形圖顯示了2倍或4倍分析中克隆面積和每個克隆的總細胞核計數(shù)的比較數(shù)據(jù)。

圖4的結(jié)果顯示2倍物鏡下所獲得的全孔圖像分析數(shù)據(jù)不亞于4倍物鏡下相同孔所獲得的相似分析數(shù)據(jù)。我們還研究了干細胞樣品板的明場成像及分析。初步結(jié)果顯示,利用Developer的**圖像預處理功能,克隆計數(shù)及形態(tài)學分析都是可行的。

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圖5. 4倍物鏡下所獲得的明場拼接圖像與熒光下所獲得的全孔2倍圖像的比較。利用Developer軟件的圖像拼接,顯示了利用4個像場在明場的4倍物鏡下所獲得的全孔圖像(A)。對2倍全孔熒光圖像(B)及相同孔的4倍物鏡明場拼接圖像(C)中的10個隨機選擇克隆進行了分析。柱形圖顯示了2倍熒光或4倍明場分析中克隆面積的比較數(shù)據(jù)。

小結(jié)

?IN Cell Analyzer 2000能利用熒光和透射光模式,進行干細胞的自動成像。

?系統(tǒng)的大照相機在2倍物鏡下能捕獲7.6×7.6 mm2的視場,實現(xiàn)快速的96孔板單圖像全孔捕獲。

結(jié)論

?2倍物鏡的分辨率對于干細胞克隆的單細胞分析已經(jīng)足夠,其數(shù)據(jù)與利用4倍物鏡所獲得的數(shù)據(jù)相當。

?更高分辨率的全孔成像可以通過系統(tǒng)的視場重疊功能及IN Cell Investigator的自動圖像拼接來實現(xiàn)

人們普遍預測干細胞研究將會對多種人類**的了解及終**產(chǎn)生重大影響。

1 干細胞的特征是具有分化成多種細胞表型的能力(多能性),但培養(yǎng)時分化的程度完全取決于細胞生長條件,而培養(yǎng)物多能性的維持常常離不開滋養(yǎng)層細胞。這些細胞的特征之一是當它們處于未分化狀態(tài)時,一般以緊密擠壓的細胞克隆生長。利用自動化熒光顯微鏡進行的高內(nèi)涵分析能夠在單細胞水平產(chǎn)生信息量豐富的數(shù)據(jù),非常適合干細胞培養(yǎng)和分化研究。

2 多能性通常是通過特定標志物如Oct-4的抗體檢測來監(jiān)控的,而分化的程度則通過不同細胞譜系的特定標志物的外觀來測量。對于這些分析的自動化成像,挑戰(zhàn)在于在常規(guī)的96孔板形式中,干細胞克隆的位置并沒有預先確定。這就需要獲取每個孔的多個視場,來確保全部區(qū)域都被覆蓋。這一點很實際,特別是當相對稀有的事件被檢測到,如干細胞克隆中的部分細胞在特定的時間點活躍地發(fā)生著有絲分裂。當需要多張圖像來捕獲全孔時,克隆有時候很大,重疊了圖像邊界,這樣就很難準確判斷克隆數(shù)量和形態(tài)。(生物幫bio1000.com)

1 Robert Graves*, 1 Zahra Masoumi & 2 Alla Zaltsman

1美國新澤西州通用電氣醫(yī)療集團;2英國英格蘭白金漢郡安瑪西亞鎮(zhèn)通用電氣醫(yī)療集團

e-mail: Robert.Graves@ge.com。

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